โครงสร้างการกำหนดส่วนราชการสำนักปลัดองค์การบริหารส่วนตำบลคลองนารายณ์ มีดังนี้
1.1 งานบริหารงานบุคคลฯ
1.2 งานวิเคราะห์นโยบายและแผน
1.3 งานงบประมาณ
1.4 งานนิติการ
1.5 งานป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย
1.6 งานกิจการสภาองค์การบริหารส่วนตำบล
1.7 งานส่งเสริมการท่องเที่ยว
1.8 งานเฝ้าระวังและควบคุมโรคติดต่อและไม่ติดต่อ
1.9 งานบริหารสาธารณสุข
1.10 งานบริการรักษาความสะอาด
1.11 งานส่งเสริมการเกษตร
1.12 งานรักษาความสงบเรียบร้อย
1.13 งานสวัสดิการสังคม
1.14 งานการพาณิชย์
1.15 งานสนับสนุนการประชาสัมพันธ์
1.16 งานธุรการ
1.17 งานราชการทั่วไป